Верно, но еще правильнее будет так.

cd ваша_директория_с_движком
chmod -R 0777 ./engine/cache ./uploads

У меня на "./" ругалось :)

./ = текущая папка.

../ = папка уровнем выше.

Это то я знаю, но именно у меня это почему то не воспринимается…

Какая у вас ОС?

Debian Lenny
uname -a
Linux main 2.6.18-2-pve #1 SMP Mon Feb 1 10:45:26 CET 2010 i686 GNU/Linux

Странно, у меня такая же и все работает. Да и на FreeBSD ранее также путь ./ распознавался верно.

Возможно все таки ядро отличается… у меня оно старовато, я использую Proxmox VE, там 18 ядро, тогда как у Lenny 26 уже…

Кстати, по поводу команды su… Я считал всегда, что для таких команд надо писать sudo… Или это не во всех дистрибутивах?

Не во всех, конечно.

Команда su будет работать в любом *nix дистрибутиве, но для ее использование требуется пароль пользователя root.
sudo же требует предварительной настройки и позволяет (в зависимости от настроек и разрешений) запускать программы с привилегиями суперпользователя без ввода пароля root

Релевантные ссылки:
su sudo

Итак, феерическая расстановка точек над chmod'ом:

Смотрим man chmod под freebsd (в данном случае 8.0):

CHMOD(1) FreeBSD General Commands Manual CHMOD(1)
NAME
chmod — change file modes

SYNOPSIS
chmod [-fhv] [-R [-H | -L | -P]] mode file…

И под linux (в данном случае Debian Lenny):

CHMOD(1) User Commands CHMOD(1)

NAME
chmod — change file mode bits

SYNOPSIS
chmod [OPTION]… MODE[,MODE]… FILE…
chmod [OPTION]… OCTAL-MODE FILE…
chmod [OPTION]… --reference=RFILE FILE…

Из этого видим, что правильными командами будут:

chmod -R 0777 ./engine/cache
chmod -R 0777 ./uploads

то есть:
[команда] [опция] [режим] [путь]